RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PKP4	Q99569	1192 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	MPDZ	O75970	2070 aa		11.36	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		H7BY64	318 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A5	O15375	505 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PJA2	O43164	708 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT3	O60678	531 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RDH16	O75452	317 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	B3GALT4	O96024	378 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	HEXA	P06865	529 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	AVPR1B	P47901	424 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	AGTR2	P50052	363 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RELA	Q04206	551 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	GBX1	Q14549	363 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	LPAR4	Q99677	370 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ZAN	Q9Y493	2812 aa		11.35	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0G2JMM0	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PPB8	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PRS3	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		A6NNC1	897 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		E7ENX8	843 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	MYO1C	O00159	1063 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PHF2	O75151	1096 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CYC1	P08574	325 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PCSK6	P29122	969 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR4D2	P58180	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TAP2	Q03519	686 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PPR1	153 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A8	O95907	504 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ACVR2A	P27037	513 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	CCNF	P41002	786 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R50	P59544	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	BTG2	P78543	158 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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