RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	WDR54	Q9H977	334 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	RFPL1	O75677	317 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	MED26	O95402	600 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	EPB42	P16452	691 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	KRT15	P19012	456 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	AHR	P35869	848 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEA12	P43365	314 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SCTR	P47872	440 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	AGTR2	P50052	363 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	RRAD	P55042	308 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PWP1	Q13610	501 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	DSG2	Q14126	1118 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	HERC3	Q15034	1050 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	RBBP7	Q16576	425 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	NKG7	Q16617	165 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SARG	Q9BW04	601 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CHID1-222	ENST00000533059	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059		H0YIG0	161 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	FFAR3	O14843	346 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	GPR42	O15529	346 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	IGHE	P01854	428 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	SHBG	P04278	402 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	TAC1	P20366	129 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	GSTM2	P28161	218 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	GCA	P28676	217 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	HNF4A	P41235	474 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	KCNC1	P48547	511 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	CSRP3	P50461	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	CHIT1	Q13231	466 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059		A0A088AWK7	358 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CHID1-222	ENST00000533059	SGK494	L7N484	410 aa		13.13	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms