RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526865.5

RRM1-204, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 4

Gene RRM1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CENPU	Q71F23	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	UBXN4	Q92575	508 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PEX13	Q92968	403 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SNF8	Q96H20	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	NDN	Q99608	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TACC2	O95359	2948 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ATR	Q13535	2644 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865		H3BMM5	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RAD51C	O43502	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	KDM1A	O60341	852 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	GPC4	O75487	556 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SPAG6	O75602	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PIAS1	O75925	651 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	USP1	O94782	785 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	UBOX5	O94941	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	AHSG	P02765	367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RPN2	P04844	631 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	UGT2B7	P16662	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF28	P17035	718 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CD9	P21926	228 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75	2e-6	■■■■■ 35.7
RRM1-204	ENST00000526865	MCM3	P25205	808 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SHMT2	P34897	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	SLC1A2	P43004	574 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PGGT1B	P53609	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	ACY1	Q03154	408 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	RBPJ	Q06330	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TUBB3	Q13509	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	CRYM	Q14894	314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	TRADD	Q15628	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	MLANA	Q16655	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRM1-204	ENST00000526865	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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