RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SGCDQ92629 289 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TAF4BQ92750 862 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CENPTQ96BT3 561 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MS4A14Q96JA4 679 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SCLT1Q96NL6 688 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PSMB7Q99436 277 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 KRT12Q99456 494 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PLIN2Q99541 437 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PIP5K1AQ99755 562 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NARFQ9UHQ1 456 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 STX8Q9UNK0 236 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.14□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 OR2M5A3KFT3 312 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PDXKO00764 312 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CETN3O15182 167 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PLPP2O43688 288 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZNF217O75362 1048 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 UCHL3P15374 230 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CDH11P55287 796 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PTENP60484 403 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 XRCC4Q13426 336 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SLC15A2Q16348 729 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 WLSQ5T9L3 541 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CROCCP2Q86T23 111 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HOOK3Q86VS8 718 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GPBP1Q86WP2 473 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TEX11Q8IYF3 940 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 METTL13Q8N6R0 699 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZNF383Q8NA42 475 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 OR8K5Q8NH50 307 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RFFLQ8WZ73 363 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MAGED4Q96JG8 741 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 LAT2Q9GZY6 243 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 P2RY12Q9H244 342 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CARD9Q9H257 536 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PELI2Q9HAT8 420 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PANK4Q9NVE7 773 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ASTN1O14525 1302 aa4.13□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 LY75O60449 1722 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GMNCA6NCL1 334 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB5O15062 677 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PI15O43692 258 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NDUFS3O75489 264 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GCNT3O95395 438 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GGPS1O95749 300 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 H2AFZP0C0S5 128 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FERP16591 822 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CBLP22681 906 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PON1P27169 355 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HOXD13P35453 343 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ITIH4Q14624 930 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 P2RY6Q15077 328 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CRY2Q49AN0 593 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms