RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPASTQ9UBP0 616 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM129A0AVI4 362 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 O00370 1275 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PSMD3O43242 534 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PRDM1O75626 825 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 GAS8O95995 478 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TSHBP01222 138 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NUDT17P0C025 328 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 GP1BBP13224 206 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 LIFP15018 202 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 FERP16591 822 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 RPA1P27694 616 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 LBX1P52954 281 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CLDN17P56750 224 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SRP54P61011 504 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CDH18Q13634 790 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TECRLQ5HYJ1 363 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 OR4C11Q6IEV9 310 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ISCA2Q86U28 154 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 BATF2Q8N1L9 274 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 LMO3Q8TAP4 145 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ALG14Q96F25 216 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 C4orf45Q96LM5 186 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 MTMR12Q9C0I1 747 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CARD9Q9H257 536 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TAAR2Q9P1P5 351 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NUDCQ9Y266 331 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SNURFLB1AK76 121 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 M0R296 226 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC22A2O15244 555 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATP6V1G1O75348 118 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 MT-ATP6P00846 226 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATP1B1P05026 303 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CHRNGP07510 517 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 GHRP10912 638 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CDK4P11802 303 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SFNP31947 248 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 DNA2P51530 1060 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 HUNKP57058 714 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 EXT1Q16394 746 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NAGSQ8N159 534 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TEX9Q8N6V9 391 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PIGQQ9BRB3 760 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 DOCK7Q96N67 2140 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 KIF5CO60282 957 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 DFFBO76075 338 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 TGFAP01135 160 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 NGFP01138 241 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms