RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	USP45	Q70EL2	814 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AREL1	O15033	823 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC16A6	O15403	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCNB2	O95067	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PEX11B	O96011	259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NSG1	P42857	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SUOX	P51687	545 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC16A1	P53985	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CNTN1	Q12860	1018 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MTA1	Q13330	715 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLOD3	O60568	738 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTTG1	O95997	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFNA8	P32881	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CSK	P41240	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	KEAP1	Q14145	624 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	EFCAB14	O75071	495 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NUDT7	P0C024	238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LAMP1	P11279	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SDC1	P18827	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CA5A	P35218	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MASP1	P48740	699 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRKAG1	P54619	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IHH	Q14623	411 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCDC115	Q96NT0	180 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PDE9A	O76083	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLITRK5	O94991	958 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITGAM	P11215	1152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC6A4	P31645	630 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFITM3	Q01628	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFNW1	P05000	195 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLTB	P09497	229 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NNMT	P40261	264 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CASP3	P42574	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26

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