RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 ACOX2Q99424 681 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TINF2Q9BSI4 451 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 U3KQ87 197 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PARP14Q460N5 1801 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 I3L521 148 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MYL12BO14950 172 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SMIM6P0DI80 62 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MYL12AP19105 171 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PSPHP78330 225 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CTBP1Q13363 440 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HKDC1Q2TB90 917 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ANKS6Q68DC2 871 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BICRALQ6AI39 1079 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 FAHD1Q6P587 224 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 AHSA2Q719I0 299 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NAT16Q8N8M0 369 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR2T29Q8NH02 315 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NT5C3BQ969T7 300 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB18Q99592 522 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RHBGQ9H310 441 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NT5DC2Q9H857 520 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CMAHPQ9Y471 501 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PQ09 198 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 EFCAB7A8K855 629 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 F5H423 210 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SYN3O14994 580 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ORC5O43913 435 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 KIAA0513O60268 411 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 AOC2O75106 756 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SUOXP51687 545 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 UFM1P61960 85 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DSC2Q02487 901 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CAMK1Q14012 370 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF460Q14592 562 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NKG7Q16617 165 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM60Q495X7 471 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR51M1Q9H341 326 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PIGUQ9H490 435 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 LDAHQ9H6V9 325 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF302Q9NR11 478 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NUDT15Q9NV35 164 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HSPB11Q9Y547 144 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 V9GYQ6 96 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ANK1P16157 1881 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GPR171O14626 319 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CREG1O75629 220 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL18O94889 574 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CCNB2O95067 398 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 IL33O95760 270 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 EDN1P05305 212 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RRASP10301 218 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PRF1P14222 555 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SLC2A4P14672 509 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ARSAP15289 507 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CBLP22681 906 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CAPZA2P47755 286 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR1G1P47890 313 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DAPP51397 102 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DIO3P55073 304 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CLDN20P56880 219 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.54□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms