RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 COPG2Q9UBF2 871 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 CENPEQ02224 2701 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 PRSS44E7EML9 344 aa15.96■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 SLC16A5O15375 505 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 RDH16O75452 317 aa15.96■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 NPPBP16860 134 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 CDKN2DP55273 166 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 PMP22Q01453 160 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 SP140Q13342 867 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.96■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 LINGO1Q96FE5 620 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.96■□□□□ 0.15
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HERC3-211ENST00000513325 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-211ENST00000513325 CREBBPQ92793 2442 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.95■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H2ADP20671 130 aa15.95■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF766Q5HY98 468 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 H3F3CQ6NXT2 135 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 PCGF5Q86SE9 256 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 PYCR2Q96C36 320 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 PEX11GQ96HA9 241 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.95■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.94■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 RHAGQ02094 409 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 TUBA3CQ13748 450 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R7Q15435 360 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 NSDHLQ15738 373 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 MSS51Q4VC12 460 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SFT2D3Q587I9 215 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 MOCOSQ96EN8 888 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 NPAS2Q99743 824 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 HAUS8Q9BT25 410 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 LANCL2Q9NS86 450 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.94■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 CCL21O00585 134 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR1F1O43749 312 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 MAN1A2O60476 641 aa15.93■□□□□ 0.14
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HERC3-211ENST00000513325 TTC4O95801 387 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN12O95859 305 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF8P28908 595 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 CD96P40200 585 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 CA7P43166 264 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 CCR8P51685 355 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ART3Q13508 389 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 EXT1Q16394 746 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 MEP1AQ16819 746 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC3-211ENST00000513325 DUPD1Q68J44 220 aa15.93■□□□□ 0.14
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