RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ALG9Q9H6U8 611 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 WWOXQ9NZC7 414 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf18Q9UK00 162 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 DYRK1BQ9Y463 629 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RELNP78509 3460 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO18BQ8IUG5 2567 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBC2A0A5B9 178 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SGK494L7N484 410 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX12O00623 359 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CD97P48960 835 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRB1Q12918 225 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM53BQ14153 422 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH9Q5TGP6 573 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FAAH2Q6GMR7 532 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RAPH1Q70E73 1250 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RELL1Q8IUW5 271 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT16Q8N428 558 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 OR11G2Q8NGC1 345 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KCTD4Q8WVF5 259 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 THAP11Q96EK4 314 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SARGQ9BW04 601 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 AICDAQ9GZX7 198 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PELI2Q9HAT8 420 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR83Q9NYM4 423 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 LUZP4Q9P127 313 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IDSB3KWA1 339 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC9O14530 226 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF4O60810 478 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NSA2O95478 260 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB4AP04350 444 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TFEBP19484 476 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GRK3P35626 688 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CASRP41180 1078 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SCTRP47872 440 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA7P48741 367 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 HNMTP50135 292 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V0D1P61421 351 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 Q0VFX4 171 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA9Q16795 377 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB8Q3ZCM7 444 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NXPE4Q6UWF7 544 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GPSM1Q86YR5 675 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC1AQ8NC01 280 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMKVQ8NCB2 501 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PDPRQ8NCN5 879 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5T3Q8NGG3 340 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1191Q96A73 305 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 IP6K3Q96PC2 410 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX15Q9NRS6 342 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA3GQ9NS98 782 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF112Q9ULX5 631 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC14AQ9UNH5 594 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NBASA2RRP1 2371 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2W5A6NFC9 320 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 UBXN8O00124 270 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 8.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJB6O75190 326 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL18O94889 574 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPIND1P05546 499 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 COX6A1P12074 109 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 EPORP19235 508 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 AVPR1BP47901 424 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 OLR1P78380 273 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 HYAL2Q12891 473 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NXNL1Q96CM4 212 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 ATOH8Q96SQ7 321 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CYTH2Q99418 400 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT8Q9BYC5 575 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf105Q9NVL8 296 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 CD274Q9NZQ7 290 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NFU1Q9UMS0 254 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP2K7O14733 419 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CELA2AP08217 269 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ACPPP15309 386 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms