RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	WISP2	O76076	250 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP9	O95302	570 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN12	O95859	305 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	APOC2	P02655	101 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	APOA4	P06727	396 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TAZ	Q16635	292 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD16	Q32M84	506 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP21	Q8N119	569 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC42	Q96M95	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1I1	O60431	355 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TPM3	P06753	285 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RBP3	P10745	1247 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB5	P28074	263 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1C1	Q15619	314 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	VRK3	Q8IV63	474 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2L3	Q8NG85	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO27	Q8NI29	283 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf90	Q96M02	699 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA13	Q96N96	652 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK13	Q9HB14	408 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQ72	361 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PLN8	166 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YGG7	62 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ASNA1	O43681	348 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SUN1	O94901	812 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX7	O95931	251 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS8	O95995	478 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TPM1	P09493	284 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF24	P17028	368 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CMPK1	P30085	196 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR7	P32248	378 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	BDKRB1	P46663	353 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HSF1	Q00613	529 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA3C	Q13748	450 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF44	Q7L0R7	432 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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