RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYT16Q17RD7 645 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 C17orf64Q86WR6 236 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGED4Q96JG8 741 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HAUS8Q9BT25 410 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SARGQ9BW04 601 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNK13Q9HB14 408 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PARVBQ9HBI1 364 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPAMQ9HCL2 828 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MED16Q9Y2X0 877 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GTF3C1Q12789 2109 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 AVILO75366 819 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CSNK1G2P78368 415 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PWP1Q13610 501 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TUBA3CQ13748 450 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NSDHLQ15738 373 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ASPGQ86U10 573 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MDS2Q8NDY4 140 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CD200R1Q8TD46 325 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCMH1Q96GD3 660 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR137Q96N19 417 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR21Q99679 349 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC30A3Q99726 388 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 F10P00742 488 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HIST1H2ADP20671 130 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CAPN3P20807 821 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 JAK1P23458 1154 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SSTR2P30874 369 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CXCR5P32302 372 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TBPL1P62380 186 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTBP1Q13363 440 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 LCTLQ6UWM7 567 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLD3Q8IV08 490 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 BEST3Q8N1M1 668 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PBKQ96KB5 322 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SGPP1Q9BX95 441 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CACNA1CQ13936 2221 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 KRT14P02533 472 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 IL1RNP18510 177 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CD96P40200 585 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC1A2P43004 574 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGEA3P43357 314 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 EFNA3P52797 238 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 AP1S2P56377 157 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CUL1Q13616 776 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 OR1C1Q15619 314 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATL1Q8WXF7 558 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SERPINB12Q96P63 405 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SGK494L7N484 410 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTC4O95801 387 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms