RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-208ENST00000493607 SLC6A12P48065 614 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 SKP1P63208 163 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 HERC3Q15034 1050 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 TGFBIQ15582 683 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 ATCAYQ86WG3 371 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 RELL1Q8IUW5 271 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 KCT2Q8NC54 265 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 NT5CQ8TCD5 201 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 AGAP4Q96P64 663 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.08■■□□□ 1.13
SERBP1-208ENST00000493607 OR1F1O43749 312 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 HEXBP07686 556 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MLLT10P55197 1068 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RAB10P61026 200 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 AP2B1P63010 937 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 REEP5Q00765 189 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RAPSNQ13702 412 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 IGFBP7Q16270 282 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 Q6ZS92 163 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC25Q86WR0 208 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 EGFL8Q99944 293 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 COPG2Q9UBF2 871 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 FLNCQ14315 2725 aa22.07■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC166P0CW27 439 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CD1DP15813 335 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 GNAZP19086 355 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 GSTM2P28161 218 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SYT16Q17RD7 645 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 TRPV3Q8NET8 790 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 OR1F2PQ96R84 312 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 LMF1Q96S06 567 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SCN2AQ99250 2005 aa22.06■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MASP2O00187 686 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 ALOX12BO75342 701 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 IL1RNP18510 177 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SLC7A5Q01650 507 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RGS1Q08116 209 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 Q0VFX4 171 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 COLEC12Q5KU26 742 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PDSS2Q86YH6 399 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PPM1NQ8N819 430 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MNS1Q8NEH6 495 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 FBF1Q8TES7 1133 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 KIAA1191Q96A73 305 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 EHD1Q9H4M9 534 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PLAAQ9Y263 795 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.05■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC189A1A4V9 331 aa22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 URADA6NGE7 173 aa22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 NDUFS4O43181 175 aa22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 KLHL18O94889 574 aa22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 SERPINA7P05543 415 aa22.04■■□□□ 1.12
SERBP1-208ENST00000493607 ICAM2P13598 275 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms