RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 UHRF2Q96PU4 802 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 NSG2Q9Y328 171 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LMX1BO60663 402 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM1O75626 825 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 NGFP01138 241 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC3A1Q07837 685 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FCRLAQ7L513 359 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GPC2Q8N158 579 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SFRP1Q8N474 314 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM99Q8N816 258 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C3Q8NH37 302 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD2Q9Y426 696 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ANTXRLA6NF34 631 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FAM72CH0Y354 149 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 M0R296 226 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FPGTO14772 594 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ACSL4O60488 711 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EML2O95834 649 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GPIP06744 558 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CPA3P15088 417 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GOT1P17174 413 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 UCP2P55851 309 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TEAD2Q15562 447 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 HFEQ30201 348 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GTDC1Q4AE62 458 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RAB12Q6IQ22 244 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MACC1Q6ZN28 852 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FAM72BQ86X60 149 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CNBD1Q8NA66 436 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 OR1L3Q8NH93 324 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS12Q96DT0 336 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 THAP2Q9H0W7 228 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 IL19Q9UHD0 177 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ARID2Q68CP9 1835 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SYCE3A1L190 88 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 H3BMM5 538 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TEX28O15482 410 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 VTNP04004 478 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-10P10266 1014 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EXT1Q16394 746 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 STPG1Q5TH74 334 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF790Q6PG37 636 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ASPGQ86U10 573 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF843Q8N446 348 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CDHR1Q96JP9 859 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SPXQ9BT56 116 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY12Q9H244 342 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PANK4Q9NVE7 773 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 STK36Q9NRP7 1315 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SNURFLB1AK76 121 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 H0YIG0 161 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 VEGFDO43915 354 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CLN5O75503 358 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GAS8O95995 478 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ANOS1P23352 680 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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