RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CREG1O75629 220 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MATN4O95460 622 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LALBAP00709 142 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 URODP06132 367 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HEXBP07686 556 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDUFB7P17568 137 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 S100PP25815 95 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUDT6P53370 316 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELP6Q0PNE2 266 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KYAT1Q16773 422 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOTUMQ6P988 496 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DET1Q7L5Y6 550 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC34A3Q8N130 599 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUDT8Q8WV74 236 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BSNDQ8WZ55 320 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NXPE2Q96DL1 559 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHF21BQ96EK2 531 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PEX11GQ96HA9 241 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED28Q9H204 178 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMC7Q9NPA0 242 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EQTNQ9NQ60 294 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS18Q9NS28 235 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR83Q9NYM4 423 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAPPAQ13219 1627 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 A8MT66 165 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 M0R233 179 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 AIPO00170 330 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FFAR3O14843 346 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR42O15529 346 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BEST1O76090 585 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 VIPP01282 170 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBP1P09467 338 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 COX5BP10606 129 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBR1P16152 277 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYN1P17600 705 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTR1BP42025 376 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXA1P55317 472 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEFA5Q01523 94 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC32Q14392 662 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMC2Q15006 297 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDO1Q16878 200 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CARD16Q5EG05 197 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 COQ5Q5HYK3 327 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC66Q68CR7 880 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOB2Q70IA6 237 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PGBD3Q8N328 593 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARMC5Q96C12 935 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTERF3Q96E29 417 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPM1MQ96MI6 270 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC38A3Q99624 504 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 G3V3Q6 166 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 WRBO00258 174 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIP5K1BO14986 540 aa6.67□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAMEF10O60809 474 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms