RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB8Q9H765 288 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF40A-210ENST00000489741 HADHAP40939 763 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEA1P43355 309 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP5OP48047 213 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LMAN1P49257 510 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKAA1Q13131 559 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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