RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 CLDN15P56746 228 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TAF10Q12962 218 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GPR17Q13304 367 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GAMTQ14353 236 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PHKG1Q16816 387 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.51□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 HERV-K104P61576 105 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 FOLH1Q04609 750 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ZNF410Q86VK4 478 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ZNF524Q96C55 264 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 GPR89BP0CG08 455 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 RPA1P27694 616 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CHRNA3P32297 505 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 MAGEA4P43358 317 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 NEK5Q6P3R8 708 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.49□□□□□ -1.69
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