RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 ZMPSTE24O75844 475 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 UGT2B4P06133 528 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CAPN1P07384 714 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CD63P08962 238 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 FGF5P12034 268 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 FOLR1P15328 257 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GM2AP17900 193 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 MAN1A1P33908 653 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RAD23BP54727 409 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ID2Q02363 134 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 INCA1Q0VD86 236 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CDC16Q13042 620 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GPS2Q13227 327 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 BIRC2Q13490 618 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CBFBQ13951 182 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CSHL1Q14406 222 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SEC23BQ15437 767 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 P3H1Q32P28 736 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ALFQ53S48 1182 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CARD16Q5EG05 197 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 DEF8Q6ZN54 512 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 MR1Q95460 341 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 CNDP1Q96KN2 507 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RAB34Q9BZG1 259 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TM6SF2Q9BZW4 377 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 UCK2Q9BZX2 261 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 LRFN1Q9P244 771 aa4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 F5H5T6 163 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TP73O15350 636 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 INSIG1O15503 277 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 HLA-DRAP01903 254 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RBMXP38159 391 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SPAM1P38567 509 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PRPHP41219 470 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GNPDA1P46926 289 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 HSPA7P48741 367 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1024LP59773 190 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PPP1CAP62136 330 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 NUCB2P80303 420 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ARF5P84085 180 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TRIM29Q14134 588 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 MPEG1Q2M385 716 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ZACNQ401N2 412 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PMF1Q6P1K2 205 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ACSM6Q6P461 480 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 SRLQ86TD4 932 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 UEVLDQ8IX04 471 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 OR10G6Q8NH81 332 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 GLMPQ8WWB7 406 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 COQ8BQ96D53 544 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 HMCESQ96FZ2 354 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 C9orf72Q96LT7 481 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 TGM7Q96PF1 710 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 ZNF559Q9BR84 538 aa4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
CNN3-206ENST00000487539 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms