RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 SLC16A5O15375 505 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TSPAN12O95859 305 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 IVDP26440 423 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ELK3P41970 407 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ZNF33BQ06732 778 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 LCTLQ6UWM7 567 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PDSS2Q86YH6 399 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HAS2Q92819 552 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 THAP11Q96EK4 314 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CYTH2Q99418 400 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ANKHQ9HCJ1 492 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ARL15Q9NXU5 204 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CELSR2Q9HCU4 2923 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CREBBPQ92793 2442 aa20.37■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 NPPBP16860 134 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HIST1H2ADP20671 130 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 GRK3P35626 688 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 DCTP40126 519 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 IL2P60568 153 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 BTBD16Q32M84 506 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PCGF5Q86SE9 256 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OLFM1Q99784 485 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 NAT9Q9BTE0 207 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.36■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 A8MUI8 341 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 GUCA1CO95843 209 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CCND1P24385 295 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 KCNK10P57789 538 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PDIK1LQ8N165 341 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OR5T3Q8NGG3 340 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SLCO2A1Q92959 643 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 MOCOSQ96EN8 888 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PEX11GQ96HA9 241 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OR4K3Q96R72 315 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.35■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 USP27XA6NNY8 438 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 NDUFS4O43181 175 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OR1F1O43749 312 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 B3GALT4O96024 378 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SERPIND1P05546 499 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ICAM2P13598 275 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TDGF1P3P51864 188 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 NR4A3Q92570 626 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SNF8Q96H20 258 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 HAUS8Q9BT25 410 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.34■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ZG16O60844 167 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 SAT1P21673 171 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CCR8P51685 355 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 AP2B1P63010 937 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OLR1P78380 273 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 MORF4L2Q15014 288 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 DUPD1Q68J44 220 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 GALNT7Q86SF2 657 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 FJX1Q86VR8 437 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OR56A3Q8NH54 315 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TSLPQ969D9 159 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 STMN3Q9NZ72 180 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 VWA7Q9Y334 891 aa20.33■□□□□ 0.85
USP40-215ENST00000484528 OR5H15A6NDH6 313 aa20.32■□□□□ 0.84
USP40-215ENST00000484528 ITGA8P53708 1063 aa20.32■□□□□ 0.84
USP40-215ENST00000484528 AP1S2P56377 157 aa20.32■□□□□ 0.84
USP40-215ENST00000484528 PER3P56645 1201 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms