RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475078.1

SZRD1-206, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-206	ENST00000475078	RDH16	O75452	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	MYBL2	P10244	700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	CDH1	P12830	882 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	CCND1	P24385	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	MST1	P26927	711 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	GRK3	P35626	688 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	CDKN2D	P55273	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PMP22	Q01453	160 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PHKG1	Q16816	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC16A5	O15375	505 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	BANF1	O75531	89 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	GABRB3	P28472	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	FNTA	P49354	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	AGTR2	P50052	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SZRD1-206	ENST00000475078	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	TTC4	O95801	387 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	NPPB	P16860	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	CCR8	P51685	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	EXT1	Q16394	746 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	TACC2	O95359	2948 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	CCL21	O00585	134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	NDUFS4	O43181	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	OR1F1	O43749	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	TSPAN12	O95859	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	AHSG	P02765	367 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	RHAG	Q02094	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	HERC3	Q15034	1050 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	NSDHL	Q15738	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SZRD1-206	ENST00000475078	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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