RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-208	ENST00000469793	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CTRC	Q99895	268 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793		A0A1B0GTL3	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	P2RX6	O15547	441 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	BRINP1	O60477	761 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CLEC3A	O75596	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SCRG1	O75711	98 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TIAF1	O95411	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CTSB	P07858	339 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	GRK2	P25098	689 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RGS1	Q08116	209 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	NDUFS4	O43181	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF749	O43361	778 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	OR4F21	O95013	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	DLGAP3	O95886	979 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SERPINA6	P08185	405 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	HBQ1	P09105	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SLC5A2	P31639	672 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ARSF	P54793	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	FRG2B	Q96QU4	278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	SEC16A	O15027	2179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CAPN1	P07384	714 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CHRNG	P07510	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	CHN1	P15882	459 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	BGN	P21810	368 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAD18-208	ENST00000469793	ARRB2	P32121	409 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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