RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FZD4Q9ULV1 537 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PADI4Q9UM07 663 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQU0 124 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GABRR3A8MPY1 467 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 J3QL48 77 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 AKAP10O43572 662 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PI15O43692 258 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNK5O95279 499 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-19P01714 112 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 FURINP09958 794 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAP2AP10114 183 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 BSGP35613 385 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B2P37059 387 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KIR3DL1P43629 444 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLCNKAP51800 687 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2CBP62714 309 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP2CAP67775 309 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZIC1Q15915 447 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CYP51A1Q16850 503 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC36A3Q495N2 470 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD46Q86W74 232 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 SYT12Q8IV01 421 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 OR10A6Q8NH74 314 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 REPS1Q96D71 796 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTERF3Q96E29 417 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MED8Q96G25 268 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SH3GL1Q99961 368 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HAUS8Q9BT25 410 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EBPLQ9BY08 206 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A8Q9BY19 250 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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