RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TRPV3Q8NET8 790 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 UBE2E3Q969T4 207 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 RAD1O60671 282 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CTSBP07858 339 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 HNF4AP41235 474 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 DNAJB13P59910 316 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PWP1Q13610 501 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 VN1R4Q7Z5H5 301 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ASPGQ86U10 573 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 NTMT1Q9BV86 223 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 HYKKA2RU49 373 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PRAMEF4O60810 478 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PRB1P04280 392 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CREB1P16220 341 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ASPHQ12797 758 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CLN3Q13286 438 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 NDUFA9Q16795 377 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 MUM1Q2TAK8 710 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ACTR8Q9H981 624 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CUTCQ9NTM9 273 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 OXSMQ9NWU1 459 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PADI1Q9ULC6 663 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 AGPSO00116 658 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SUPT7LO94864 414 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 RORAP35398 523 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CCNG1P51959 295 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ABHD18Q0P651 414 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 UNC50Q53HI1 259 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 DSELQ8IZU8 1212 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 NKD1Q969G9 470 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TMEM237Q96Q45 408 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 FAM117AQ9C073 453 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 LHX9Q9NQ69 397 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 STARD5Q9NSY2 213 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 A0A1B0GX78 115 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 MEN1O00255 615 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 DSCR3O14972 297 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TM9SF1O15321 606 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 25.5
C9orf3-209ENST00000460573 CLDN9O95484 217 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 OTCP00480 354 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 AGXTP21549 392 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SERPINB1P30740 379 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 CLCQ05315 142 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 RGS1Q08116 209 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 GPS2Q13227 327 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 HKDC1Q2TB90 917 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 LIPMQ5VYY2 423 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 MED27Q6P2C8 311 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 LAS2Q8IYD9 372 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 NT5CQ8TCD5 201 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 REPS1Q96D71 796 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-209ENST00000460573 MVB12AQ96EY5 273 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms