RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2T3Q8NH03 318 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SAP25Q8TEE9 199 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IRGQQ8WZA9 623 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF607Q96SK3 696 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC77Q9BR77 488 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PANK2Q9BZ23 570 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 VCX2Q9H322 139 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TOR3AQ9H497 397 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SPACA6W5XKT8 324 aa4.37□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKQ9UM73 1620 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM89A2RUT3 159 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM25EA8MYX2 175 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf105B2RV13 164 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 H0Y8G0 127 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A2O15244 555 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 LRP3O75074 770 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 GRAP2O75791 330 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 WISP2O76076 250 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX30O94993 753 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 STBD1O95210 358 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PROS1P07225 676 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF2P09038 288 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 GZMAP12544 262 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ARSBP15848 533 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 RPA2P15927 270 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 GOT1P17174 413 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V1C1P21283 382 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEA11P43364 429 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF4P43489 277 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 VAMP7P51809 220 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF17Q02223 184 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF415Q09FC8 603 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IDI1Q13907 227 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PHKG1Q16816 387 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IL23RQ5VWK5 629 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TPGS2Q68CL5 300 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC27Q6P3X3 843 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TDHQ8IZJ6 230 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 LGI2Q8N0V4 545 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 CASP10Q92851 521 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PIGTQ969N2 578 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TPD52L3Q96J77 140 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PSKH2Q96QS6 385 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP26Q9BV47 211 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 NACA2Q9H009 215 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 MIS12Q9H081 205 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 KLK15Q9H2R5 256 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 NARFQ9UHQ1 456 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCC4O15439 1325 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.36□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0U1RQV5 110 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 hDV102S1A0JD36 115 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 I6L893 689 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ARPC2O15144 300 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM12O43184 909 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 PIGNO95427 931 aa4.35□□□□□ -1.71
CBX1P4-201ENST00000439415 RAF1P04049 648 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms