RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 KCNQ1P51787 676 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 UFM1P61960 85 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 TXNDC8Q6A555 127 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 BBS10Q8TAM1 723 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SMPDL3BQ92485 455 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SGCDQ92629 289 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 FAM83CQ9BQN1 747 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 MKS1Q9NXB0 559 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 LEFTY2O00292 366 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 GNB5O14775 395 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 HK1P19367 917 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SLC11A1P49279 550 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 TLE2Q04725 743 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 PCLAFQ15004 111 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 ZNF613Q6PF04 617 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 CCDC115Q96NT0 180 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SAMD11Q96NU1 681 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 RANBP9Q96S59 729 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 TBX5Q99593 518 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 GALPQ9UBC7 116 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 CYTH4Q9UIA0 394 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 VSTM5A8MXK1 200 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 PPEF2O14830 753 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SCAMP1O15126 338 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 SHMT2P34897 504 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 C2orf27AQ580R0 203 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 OR4K17Q8NGC6 315 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 RNF39Q9H2S5 420 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 EBF2Q9HAK2 575 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 MKLN1Q9UL63 735 aa12.71□□□□□ -0.37
TNS1-205ENST00000419504 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PCDHGA12O60330 932 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 GP1BBP13224 206 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PLGLB1Q02325 96 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 NFATC2Q13469 925 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 SYT16Q17RD7 645 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 P4HA3Q7Z4N8 544 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 AQP11Q8NBQ7 271 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 B3GNT4Q9C0J1 378 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 VRTNQ9H8Y1 702 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 IFT52Q9Y366 437 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 TNFRSF10BO14763 440 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PRH1P02810 166 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CFHP08603 1231 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 RHDQ02161 417 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ZNF763Q0D2J5 394 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 DSG2Q14126 1118 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PON3Q15166 354 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CEP97Q8IW35 865 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ZNF615Q8N8J6 731 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 RAB7BQ96AH8 199 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ALPK1Q96QP1 1244 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 BRD7Q9NPI1 651 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 MAFFQ9ULX9 164 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 L7N2F9 121 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 MMP20O60882 483 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 IFNA21P01568 189 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 RPS13P62277 151 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 VAMP2P63027 116 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 OGDHQ02218 1023 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 GSTM4Q03013 218 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 COLEC12Q5KU26 742 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 FAM46DQ8NEK8 389 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CITED4Q96RK1 184 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ZNF382Q96SR6 550 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CYP17A1P05093 508 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 G6PDP11413 515 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 SEMG2Q02383 582 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 TEAD2Q15562 447 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ARHGAP40Q5TG30 622 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 PQLC3Q8N755 202 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 BIRC7Q96CA5 298 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-205ENST00000419504 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms