RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 IL1RNP18510 177 aa26.27■■□□□ 1.8
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ANKRD54-203ENST00000407117 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.23■■□□□ 1.79
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ANKRD54-203ENST00000407117 NEIL2Q969S2 332 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 MCMBPQ9BTE3 642 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa26.23■■□□□ 1.79
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ANKRD54-203ENST00000407117 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
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ANKRD54-203ENST00000407117 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 RGS1Q08116 209 aa26.22■■□□□ 1.79
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ANKRD54-203ENST00000407117 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 SIRT6Q8N6T7 355 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 OR1F2PQ96R84 312 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF32Q9H0A6 362 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 PELI2Q9HAT8 420 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 ZFP69BQ9UJL9 534 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 DYRK1BQ9Y463 629 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 OARD1Q9Y530 152 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNE2Q9Y6J6 123 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC7O00311 574 aa26.21■■□□□ 1.79
ANKRD54-203ENST00000407117 AHRP35869 848 aa26.21■■□□□ 1.79
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