RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMD8P48556 350 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DAPL1A0PJW8 107 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FUOMA2VDF0 154 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DUXAA6NLW8 204 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DPB1P04440 258 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 EPHX1P07099 455 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC5A2P31639 672 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.136e-10■■□□□ 13.4
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GAB3Q8WWW8 586 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PHOX2BQ99453 314 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 REEP4Q9H6H4 257 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM172BPA6NC97 362 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RLN1P04808 185 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PCCBP05166 539 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD3B1P14060 373 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 AMD1P17707 334 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD3B2P26439 372 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC36A3Q495N2 470 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ARSIQ5FYB1 569 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MAVSQ7Z434 540 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RGMAQ96B86 450 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR51B5Q9H339 312 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NT5EP21589 574 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ACRV1P26436 265 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPSNQ13702 412 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SMU1Q2TAY7 513 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ASPNQ9BXN1 380 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PRU2 124 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DLGAP1O14490 977 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC16A5O15375 505 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 COCHO43405 550 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN9O75954 239 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GNAO1P09471 354 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN2P17706 415 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSL1P33121 698 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DCTP40126 519 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MNDAP41218 407 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP5CP53041 499 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GK3PQ14409 553 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 EIPR1Q53HC9 387 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KREMEN2Q8NCW0 462 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM129BQ96TA1 746 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX14O95416 240 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MPIP34949 423 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKEP52429 567 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FADDQ13158 208 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB118Q96PH6 123 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMB1P07942 1786 aa15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR1E2P47887 323 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 STARP49675 285 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CBLBQ13191 982 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf183Q5T699 404 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM171BQ6P995 826 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CARM1Q86X55 608 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF130Q86XS8 419 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LILRA2Q8N149 483 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR48Q8TAF3 677 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NCSTNQ92542 709 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms