RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ABATP80404 500 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 USP43Q70EL4 1123 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD13Q7L211 337 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RTP4Q96DX8 246 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF221Q9UK13 617 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FESP07332 822 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ALPPL2P10696 532 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 BCKDHAP12694 445 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM172BPA6NC97 362 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NPPAP01160 153 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DNASE1L1P49184 302 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 APCDD1Q8J025 514 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC22A1O15245 554 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4D1Q15615 310 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOA3Q8NG57 546 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 UCK2Q9BZX2 261 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 EURLQ9NYK6 297 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB25P57735 213 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPEARQ8WU66 669 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 J3QRK9 145 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AURKAO14965 403 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 B4GALT2O60909 372 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RFPL2O75678 378 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PDYNP01213 254 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TYRP1P17643 537 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXL8Q96CD0 374 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RANBP9Q96S59 729 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF24Q9UPV7 400 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM170BA6NMN3 283 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACRV1P26436 265 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 HMGCLP35914 325 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ID2Q02363 134 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MUS81Q96NY9 551 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NUMA1Q14980 2115 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAP29O95721 258 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PFKMP08237 780 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF12P17014 697 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 XKR5Q6UX68 686 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SCD5Q86SK9 330 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SP140LQ9H930 580 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC10A3P09131 477 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACVR2AP27037 513 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACADLP28330 430 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TGFBR2P37173 567 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SH3BP2P78314 561 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ISCA2Q86U28 154 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SMPDL3BQ92485 455 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TAMM41Q96BW9 452 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH7P12883 1935 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PPW3 197 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACOX3O15254 700 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF823P16415 610 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PTNP21246 168 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 STARP49675 285 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RORCP51449 518 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GMFBP60983 142 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CFL2Q9Y281 166 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM44Q2T9K0 475 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUB2Q96DC9 234 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 REEP4Q9H6H4 257 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AIG1Q9NVV5 245 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms