RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369306.7

PEX11B-201, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 11 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PEX11B, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 LRRC72A6NJI9 287 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 C10orf142B7Z368 130 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CXCR6O00574 342 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TPST1O60507 370 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 LYNP07948 512 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RETP07949 1114 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 GABRG2P18507 467 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PKLRP30613 574 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SERPINB1P30740 379 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 NFATC4Q14934 902 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ATP6AP1Q15904 470 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SERPINA11Q86U17 422 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 C10orf111Q8N326 155 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 WDR48Q8TAF3 677 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 FAM3CQ92520 227 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 OR2M4Q96R27 311 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CHID1Q9BWS9 393 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 REEP4Q9H6H4 257 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 MYNNQ9NPC7 610 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.74□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 EVPLLA8MZ36 301 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TXNDC9O14530 226 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 MBTPS2O43462 519 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SEMA3DO95025 777 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 APBB3O95704 486 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ASGR2P07307 311 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CKMT2P17540 419 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 GPX2P18283 190 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PSMB5P28074 263 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PDE7AQ13946 482 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PDK3Q15120 406 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RPE65Q16518 533 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 BMFQ96LC9 184 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SEPHS2Q99611 448 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CENPKQ9BS16 269 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SCOCQ9UIL1 159 aa14.73□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 C7orf72A4D263 438 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 FAM149AA5PLN7 773 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 H7BY64 318 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 CLIC1O00299 241 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 EPN2O95208 641 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RAP2AP10114 183 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ENGP17813 658 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 SLC14A1Q13336 389 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 NRF1Q16656 503 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 RNF145Q96MT1 663 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 WDR92Q96MX6 357 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 MS4A8Q9BY19 250 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 C8orf4Q9NR00 106 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 AHSPQ9NZD4 102 aa14.72□□□□□ -0.05
PEX11B-201ENST00000369306 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms