RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN14Q15678 1187 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEP1BQ16820 701 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TYSND1Q2T9J0 566 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 WLSQ5T9L3 541 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCEANCQ8N8B7 351 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEKT1Q969V4 418 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSSK2Q96PF2 358 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP28Q96RU2 1077 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT12Q99456 494 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATG101Q9BSB4 218 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI4K2AQ9BTU6 479 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBQLN3Q9H347 655 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PANK4Q9NVE7 773 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 BARHL2Q9NY43 387 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 HACD3Q9P035 362 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS18Q9P253 973 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0B4J203 849 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 A4D1N5 150 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR11A4FU01 709 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MVM7 634 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGRMC2O15173 223 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF9O43307 516 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYTIPO60759 359 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHEP01854 428 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITIH1P19827 911 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2A7P20853 494 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRKP42685 505 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1D5P58170 312 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK11-1P61568 191 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSNK2BP67870 215 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFE2L1Q14494 772 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLMAPQ14BN4 828 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPA1Q15181 289 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAB1Q15750 504 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQCCQ4KMZ1 466 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF542PQ5EBM4 170 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC158Q5M9N0 1113 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL10Q6JEL2 608 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 MACC1Q6ZN28 852 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZER1Q7Z7L7 766 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD46Q86W74 232 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF614Q8N883 585 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0895Q8NCT3 520 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR7G3Q8NG95 312 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF519Q8TB69 540 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGF29Q96ES7 293 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf48Q96LS8 159 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSMCE3Q96MG7 304 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM206Q9H813 350 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLKQ9UBT6 870 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR132Q9UNW8 380 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms