RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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GDE1-201ENST00000353258 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.23■□□□□ 0.19
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GDE1-201ENST00000353258 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
GDE1-201ENST00000353258 RAMP2O60895 175 aa16.22■□□□□ 0.19
GDE1-201ENST00000353258 TSC22D2O75157 780 aa16.22■□□□□ 0.19
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