RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5AP00167 134 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SGCBQ16585 318 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NPWQ8N729 165 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MOAP1Q96BY2 351 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF726A6NNF4 738 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CBFA2T3O75081 653 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CREG1O75629 220 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FPR1P21462 350 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C5AR1P21730 350 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RHDQ02161 417 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf40Q86WS4 652 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NFKBIDQ8NI38 313 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAR1Q8WVX9 515 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LDB2O43679 373 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 VIPR2P41587 438 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 STEAP4Q687X5 459 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF3P17036 446 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPHS1P49903 392 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO43Q4G163 708 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GRHL3Q8TE85 626 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO9BQ13459 2157 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf47O95873 294 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GBAP04062 536 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGB1P05556 798 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CST6Q15828 149 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMBIM1Q969X1 311 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMC5Q96C12 935 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PYURFQ96I23 114 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH6Q9H252 994 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR45Q9Y484 360 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA3P01011 423 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ACADVLP49748 655 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM25Q86YD3 366 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 APCDD1Q8J025 514 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53INP1Q96A56 240 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RTP4Q96DX8 246 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCB9Q9NP78 766 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 K7ERQ8 282 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX10O75333 385 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RLN1P04808 185 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 AP3S2P59780 193 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT16Q17RD7 645 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MEIOBQ8N635 442 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PJA1Q8NG27 643 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF222Q9UK12 451 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRODHO43272 600 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ASGR2P07307 311 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C6P13671 934 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OXTRP30559 389 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SMSP52788 366 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TLR1Q15399 786 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SCRN2Q96FV2 425 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms