RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 REEP4Q9H6H4 257 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 ATAD3AQ9NVI7 634 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 EGFL7Q9UHF1 273 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 ICKQ9UPZ9 632 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 SZT2Q5T011 3432 aa15.6■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 CLEC3AO75596 197 aa15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 BTBD9Q96Q07 612 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 PKP2Q99959 881 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 OR51B5Q9H339 312 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 FLCNQ8NFG4 579 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 GPR156Q8NFN8 814 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-202ENST00000338546 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.58■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.58■□□□□ 0.09
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HPS1-202ENST00000338546 ACTR1AP61163 376 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 LPCAT4Q643R3 524 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ANO7Q6IWH7 933 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.58■□□□□ 0.08
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