RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 CSTBP04080 98 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 DNASE1L3Q13609 305 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 KCNH6Q9H252 994 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN25C9JDP6 229 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 FZD9O00144 591 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA5P08648 1049 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GP1BBP13224 206 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 MAN2A2P49641 1150 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 FCGR1BQ92637 280 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD7Q96MP8 289 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ASPNQ9BXN1 380 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 IL21RQ9HBE5 538 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R1Q9NYW7 299 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZIM2Q9NZV7 527 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 L7N2F9 121 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PCSK2P16519 638 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 VAMP2P63027 116 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC80Q76M96 950 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf80Q86SX3 495 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RNF130Q86XS8 419 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf62Q9BQA9 187 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 UCK2Q9BZX2 261 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 B4GALT6Q9UBX8 382 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CFL2Q9Y281 166 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 HCKP08631 526 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 KCNE1P15382 129 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 BMP8BP34820 402 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SMSP52788 366 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TSTQ16762 297 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PSKH2Q96QS6 385 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GRHPRQ9UBQ7 328 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 MEMO1Q9Y316 297 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GPR17Q13304 367 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 DNM1P34Q6PK57 102 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF611Q8N823 705 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 STON2Q8WXE9 905 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 NXPE2Q96DL1 559 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 NID2Q14112 1375 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SOD2P04179 222 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 AGTR2P50052 363 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GPX6P59796 221 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 JAG1P78504 1218 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM17P78536 824 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR8H3Q8N146 312 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GATSQ8NAP1 163 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR9I1Q8NGQ6 314 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 M0QX08 132 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ACOX3O15254 700 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RLN2P04090 185 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CCINQ13939 588 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 C12orf40Q86WS4 652 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR6N1Q8NGY5 312 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SLC29A3Q9BZD2 475 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PARPBPQ9NWS1 579 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPL8 197 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 COCHO43405 550 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 FHP07954 510 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 DERL2Q9GZP9 239 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PLOD2O00469 737 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 H6PDO95479 791 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SCNN1AP37088 669 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T29Q8NH02 315 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ASB9Q96DX5 294 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF11O60813 436 aa21.68■■□□□ 1.06
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