RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 TCP10LQ8TDR4 215 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 NTMT1Q9BV86 223 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 FAM117AQ9C073 453 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 ACTR8Q9H981 624 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC88CQ9P219 2028 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WV48 116 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GX78 115 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 DCDP81605 110 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD53Q8N9V6 530 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MR1Q95460 341 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa25.51■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TYROBPO43914 113 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SUPT7LO94864 414 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CCNG1P51959 295 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB13P59910 316 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RGS1Q08116 209 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 FAM53BQ14153 422 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 BROXQ5VW32 411 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 GRHL2Q6ISB3 625 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 NT5CQ8TCD5 201 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MVB12AQ96EY5 273 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 GBP5Q96PP8 586 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf62Q9BQA9 187 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TMBIM4Q9HC24 238 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 WDR70Q9NW82 654 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 OXSMQ9NWU1 459 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.5■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 URADA6NGE7 173 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 P2RX6O15547 441 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 NDUFS4O43181 175 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN9O95484 217 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SERPIND1P05546 499 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CREB1P16220 341 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TCN2P20062 427 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CD22P20273 847 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CLCQ05315 142 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 UNC50Q53HI1 259 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf189Q5VU69 101 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MED27Q6P2C8 311 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM237Q96Q45 408 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RHBGQ9H310 441 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB26Q9HCK0 441 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRE2Q9UHX3 823 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C21orf140B9A014 251 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 OR7A17O14581 309 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 OTCP00480 354 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINA6P08185 405 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CD63P08962 238 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINB1P30740 379 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ASPHQ12797 758 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 LAS2Q8IYD9 372 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB9Q96C00 473 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 REPS1Q96D71 796 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf90Q96M02 699 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 GPR87Q9BY21 358 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 DRC3Q9H069 523 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CHST8Q9H2A9 424 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SLC17A7Q9P2U7 560 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 KCND3Q9UK17 655 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A7Q9Y694 548 aa25.48■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC3AO75596 197 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MLYCDO95822 493 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ONECUT2O95948 504 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms