RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SH3BGRLO75368 114 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IMPDH1P20839 514 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ALAS2P22557 587 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 F8A1P23610 371 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ITPKBP27987 946 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH3A1P30838 453 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GRK3P35626 688 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 HNF4AP41235 474 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CASP2P42575 452 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CLCQ05315 142 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 HYAL2Q12891 473 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 E2F2Q14209 437 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NAA25Q14CX7 972 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TTMPQ5BVD1 217 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CES4AQ5XG92 561 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CNPY4Q8N129 248 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 WDR34Q96EX3 536 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GBP5Q96PP8 586 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CHST8Q9H2A9 424 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EHD1Q9H4M9 534 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL31Q9H511 634 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ACTR8Q9H981 624 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CUTCQ9NTM9 273 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OXSMQ9NWU1 459 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SENP1Q9P0U3 644 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FFAR3O14843 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GPR42O15529 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFS4O43181 175 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EFSO43281 561 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FOXS1O43638 330 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJB6O75190 326 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LIPCP11150 499 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR1D4P47884 311 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NEK2P51955 445 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCDH1Q08174 1060 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GRM7Q14831 915 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TBCCQ15814 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TCTE1Q5JU00 501 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ASPGQ86U10 573 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DSELQ8IZU8 1212 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR7G3Q8NG95 312 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NDC1Q9BTX1 674 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LHX9Q9NQ69 397 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IL17BQ9UHF5 180 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMCO1Q9UM00 188 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0G2JN53 185 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 WDR91A4D1P6 747 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 KLK10O43240 276 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 OR4F21O95013 312 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CAPN1P07384 714 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 IL1RNP18510 177 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ARRB2P32121 409 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 STAT5AP42229 794 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1A2P50993 1020 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CCNG1P51959 295 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RBBP7Q16576 425 aa8.65□□□□□ -1.02
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