RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305031.4

CHSY3-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY3, Length 3,850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3-201ENST00000305031 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SLC28A2O43868 658 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 DCKP27707 260 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FOXM1Q08050 763 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 LRRC66Q68CR7 880 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF675Q8TD23 568 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PIGKQ92643 395 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PHOX2BQ99453 314 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TEX12Q9BXU0 123 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 NLNQ9BYT8 704 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 AQP9O43315 295 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ERN1O75460 977 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 IFNA14P01570 189 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 KDELR2P33947 212 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 NPRL3Q12980 569 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SMU1Q2TAY7 513 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 WBP2Q969T9 261 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF583Q96ND8 569 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ASF1AQ9Y294 204 aa15.6■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FAM92AA1XBS5 289 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 GLOD5A6NK44 160 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CDRT1O95170 752 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CAPNS1P04632 268 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TALDO1P37837 337 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 BDKRB1P46663 353 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PTSQ03393 145 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 AQP6Q13520 282 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TUBA3CQ13748 450 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CEP68Q76N32 757 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CD200R1Q8TD46 325 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 MARCH5Q9NX47 278 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 KIAA0513O60268 411 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FPR1P21462 350 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 MAGEA12P43365 314 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 AP1S1P61966 158 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 Q6ZVL8 140 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ZNF382Q96SR6 550 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 BTN3A3O00478 584 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 HAT1O14929 419 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PRAMEF12O95522 483 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ETFAP13804 333 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CDKN2CP42773 168 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 GPAT3Q53EU6 434 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FRG2Q64ET8 278 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FRG2BQ96QU4 278 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SERHLQ9NQF3 203 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SATB2Q9UPW6 733 aa15.59■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 FAM227AF5H4B4 570 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 HNF1BP35680 557 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 ATP4BP51164 291 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CTBSQ01459 385 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 COX10Q12887 443 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 HSPB11Q9Y547 144 aa15.58■□□□□ 0.09
CHSY3-201ENST00000305031 TARM1B6A8C7 271 aa15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 ABATP80404 500 aa15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 USP43Q70EL4 1123 aa15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 CHST9Q7L1S5 443 aa15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.58■□□□□ 0.08
CHSY3-201ENST00000305031 BBS4Q96RK4 519 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms