RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM136AQ96C01 138 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NPAS2Q99743 824 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LRFN1Q9P244 771 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF6Q9Y252 685 aa15.2■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 H0YIG0 161 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 HAT1O14929 419 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NME2P1O60361 137 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC25A12O75746 678 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TUBB4AP04350 444 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TPOP07202 933 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ERGP11308 486 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NME2P22392 152 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 XCR1P46094 333 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TAS2R50P59544 299 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RELAQ04206 551 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF5AQ12840 1032 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PTK6Q13882 451 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF425Q6IV72 752 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC6Q86X45 466 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SHISA5Q8N114 240 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 UCK2Q9BZX2 261 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NIPSNAP2O75323 286 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MATN4O95460 622 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 IFNB1P01574 187 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 IL1RNP18510 177 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FMO4P31512 558 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PTGER1P34995 402 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FDFT1P37268 417 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PNLIPRP1P54315 467 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CEBPEQ15744 281 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PEX13Q92968 403 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.18■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1B0GTH9 108 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MYO1CO00159 1063 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SMAPO00193 183 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SFT2D3Q587I9 215 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PCGF5Q86SE9 256 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PKP4Q99569 1192 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LPAR4Q99677 370 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.17■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF839A8K0R7 811 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SGK494L7N484 410 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 NDC80O14777 642 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KLK8O60259 260 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF5CO60282 957 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PRMT3O60678 531 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CATP04040 527 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CHRM3P20309 590 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 DNASE1P24855 282 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 CYB561P49447 251 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ABATP80404 500 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 LTBQ06643 244 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PCID2Q5JVF3 399 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 ACAD11Q709F0 780 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 BIVMQ86UB2 503 aa15.16■□□□□ 0.02
CLEC1B-201ENST00000298527 MPP5Q8N3R9 675 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms