RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CPTPQ5TA50 214 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 STARD8Q92502 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FIG4Q92562 907 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.84■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FAM149AA5PLN7 773 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KLK1P06870 262 aa21.83■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 HTR1BP28222 390 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 HPCAL1P37235 193 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV3Q8NET8 790 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 SEPHS2Q99611 448 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 RHBGQ9H310 441 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 COQ10BQ9H8M1 238 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.83■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ELOVL7A1L3X0 281 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 APBB3O95704 486 aa21.82■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 GZMMP51124 257 aa21.82■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 GSTA4O15217 222 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA6P08133 673 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 UMPSP11172 480 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNB1P11230 501 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CXCR2P25025 360 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 AKT2P31751 481 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 POLE2P56282 527 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MC1RQ01726 317 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 IRGCQ6NXR0 463 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CAMKMTQ7Z624 323 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PLD3Q8IV08 490 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SNX19Q92543 992 aa21.82■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.82■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 KLC1Q07866 573 aa21.81■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 C16orf78Q8WTQ4 265 aa21.81■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 COQ8BQ96D53 544 aa21.81■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.81■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.81■■□□□ 1.08
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VSTM4-201ENST00000298454 REEP4Q9H6H4 257 aa21.81■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 GORASP2Q9H8Y8 452 aa21.81■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CA14Q9ULX7 337 aa21.81■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.81■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PLPP1O14494 284 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC9O14530 226 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 OR1F1O43749 312 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 GMNNO75496 209 aa21.8■■□□□ 1.08
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