RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PDSS2Q86YH6 399 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MARVELD3Q96A59 401 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SGPP1Q9BX95 441 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 COPG2Q9UBF2 871 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SEC14L3Q9UDX4 400 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SCN3AQ9NY46 2000 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SLC16A5O15375 505 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 NRDCO43847 1150 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 GABRB3P28472 473 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 GRK3P35626 688 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 AGTR2P50052 363 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CDKN2DP55273 166 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PMP22Q01453 160 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PHKG1Q16816 387 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ACER2Q5QJU3 275 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 FCRLBQ6BAA4 426 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 LCTLQ6UWM7 567 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PCGF5Q86SE9 256 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 BEST3Q8N1M1 668 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 LINGO1Q96FE5 620 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF354BQ96LW1 612 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 KCNK13Q9HB14 408 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SCN2AQ99250 2005 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 BANF1O75531 89 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SLC35G6P0C7Q6 338 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 NPPBP16860 134 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H2ADP20671 130 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 FNTAP49354 379 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF766Q5HY98 468 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD9Q8NBP5 474 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF860A6NHJ4 632 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CCL21O00585 134 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TTC4O95801 387 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 AHSGP02765 367 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TNFRSF8P28908 595 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R7Q15435 360 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 EXT1Q16394 746 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SFT2D3Q587I9 215 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 M1APQ8TC57 530 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PYCR2Q96C36 320 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PEX11GQ96HA9 241 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HAUS8Q9BT25 410 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CREBBPQ92793 2442 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PRF1P14222 555 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 IL10P22301 178 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CA7P43166 264 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ST13P50502 369 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CCR8P51685 355 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 RHAGQ02094 409 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 RBPJQ06330 500 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ART3Q13508 389 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TUBA3CQ13748 450 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 HERC3Q15034 1050 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 NSDHLQ15738 373 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MEP1AQ16819 746 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MSS51Q4VC12 460 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 DUPD1Q68J44 220 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 PLPP5Q8NEB5 264 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 OR5T3Q8NGG3 340 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 MOCOSQ96EN8 888 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL3-201ENST00000296026 SNF8Q96H20 258 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms