RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RDH12Q96NR8 316 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.21■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PRAMEF11O60813 436 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ASGR1P07306 291 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ASMTP46597 345 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 EMP3P54852 163 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IQCHQ86VS3 1027 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ING5Q8WYH8 240 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 APIPQ96GX9 242 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GNB5O14775 395 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KDM4BO94953 1096 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LAMP1P11279 417 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ELNP15502 786 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 EDNRBP24530 442 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IFNGR2P38484 337 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TEAD4Q15561 434 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KCNA10Q16322 511 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 INAVAQ3KP66 663 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LRRC66Q68CR7 880 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ARL9Q6T311 187 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SNX20Q7Z614 316 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PELI3Q8N2H9 469 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 METTL4Q8N3J2 472 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NANSQ9NR45 359 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DHRS7Q9Y394 339 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 COL4A1P02462 1669 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PDPK1O15530 556 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NUAK1O60285 661 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TACR1P25103 407 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AVPR1BP47901 424 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 BICRALQ6AI39 1079 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KDELC1Q6UW63 502 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF583Q96ND8 569 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.2■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GLOD5A6NK44 160 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MED27Q6P2C8 311 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 USP7Q93009 1102 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NEURL2Q9BR09 285 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NME7Q9Y5B8 376 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 EVPLQ92817 2033 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HRH2P25021 359 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HTR7P34969 479 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TAS2R50P59544 299 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 Q6ZSR9 355 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SPRED1Q7Z699 444 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MID1O15344 667 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NUDT7P0C024 238 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms