RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 RHNO1Q9BSD3 238 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 H7BY64 318 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CRYBA2P53672 197 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TAS2R38P59533 333 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ABHD18Q0P651 414 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PARM1Q6UWI2 310 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 OR52J3Q8NH60 311 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 NCSTNQ92542 709 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 GPATCH2Q9NW75 528 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM45AQ9NWC5 275 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 DMTF1Q9Y222 760 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 XPNPEP2O43895 674 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO1DO94832 1006 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 FCARP24071 287 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 DGKEP52429 567 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 C2orf80Q0P641 193 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MPEG1Q2M385 716 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 VMACQ2NL98 169 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SMU1Q2TAY7 513 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KCNK6Q9Y257 313 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 UBE3AQ05086 875 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MTAPQ13126 283 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 RUNX3Q13761 415 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL18O94889 574 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ACP5P13686 325 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 GDI1P31150 447 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KDELR2P33947 212 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ALDH3B2P48448 385 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CLCNKAP51800 687 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PNLIPRP1P54315 467 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP2R2BQ00005 443 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ELP6Q0PNE2 266 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PLXNA2O75051 1894 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO10Q9HD67 2058 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ALDH9A1P49189 494 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 USP51Q70EK9 711 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM124AQ86V42 546 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 AMZ2Q86W34 360 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TMIEQ8NEW7 156 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 F2RL3Q96RI0 385 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A087WXM4 84 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PRPH2P23942 346 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ACADLP28330 430 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.023e-7■■□□□ 13.2
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR141Q7Z602 305 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ADCK2Q7Z695 626 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SMYD1Q8NB12 490 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms