RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 RCN2Q14257 317 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SPCS2Q15005 226 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 NCF4Q15080 339 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MOGQ16653 247 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MEP1BQ16820 701 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA46Q5T0L3 261 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ERMARDQ5T6L9 678 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ERICH5Q6P6B1 374 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SUSD1Q6UWL2 747 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CLEC17AQ6ZS10 378 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 DNAAF3Q8N9W5 541 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 POGLUT1Q8NBL1 392 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 OR6S1Q8NH40 331 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 METTL6Q8TCB7 284 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SCFD2Q8WU76 684 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KIFAP3Q92845 792 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MR1Q95460 341 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 FAM20AQ96MK3 541 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PIGMQ9H3S5 423 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 AZI2Q9H6S1 392 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM206Q9H813 350 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 LY9Q9HBG7 655 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TAS2R10Q9NYW0 307 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 EHD2Q9NZN4 543 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 COPG2Q9UBF2 871 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CD300AQ9UGN4 299 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 HMGXB4Q9UGU5 601 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 DDX19BQ9UMR2 479 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.965e-9■■■□□ 14.8
GPBP1-201ENST00000264779 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.84□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 A0A1W2PP11 408 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SYCE3A1L190 88 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 GOLGA8MH3BSY2 632 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ATP2A1O14983 1001 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CHUKO15111 745 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PAGE4O60829 102 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SEC14L2O76054 403 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KLHL2O95198 593 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 DIRAS3O95661 229 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 NR3C1P04150 777 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ALPPP05187 535 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 RNF224P0DH78 156 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ALPPL2P10696 532 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PTAFRP25105 342 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 GCH1P30793 250 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CHRNB4P30926 498 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TAF6P49848 677 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 MLLT10P55197 1068 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KDSRQ06136 332 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 DNAJC3Q13217 504 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP19Q14CB8 494 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TECRLQ5HYJ1 363 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 NHSL2Q5HYW2 709 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ATL3Q6DD88 541 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 NOTUMQ6P988 496 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC121Q6ZUS5 278 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ANO5Q75V66 913 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 ARMCX2Q7L311 632 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 CHST3Q7LGC8 479 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 GPR142Q7Z601 462 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SFRP1Q8N474 314 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 BANPQ8N9N5 519 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 URGCPQ8TCY9 931 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 FCAMRQ8WWV6 532 aa2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
GPBP1-201ENST00000264779 FAM149B1Q96BN6 582 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms