RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.62□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 HLA-DPB1P04440 258 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 MAPKAPK2P49137 400 aa14.61□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.61□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 GBAP04062 536 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.6□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PPTC7Q8NI37 304 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SCRN2Q96FV2 425 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SLC32A1Q9H598 525 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 PEPDP12955 493 aa14.6□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 KEAP1Q14145 624 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 EFR3AQ14156 821 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.6□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 SPERTQ8NA61 448 aa14.6□□□□□ -0.07
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CASC3-201ENST00000264645 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 SETD6Q8TBK2 473 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ACBD6Q9BR61 282 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 EQTNQ9NQ60 294 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC3-201ENST00000264645 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.6□□□□□ -0.07
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