RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK6Q92876 244 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ULK4Q96C45 1275 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO19Q96H55 970 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD4Q9ULV1 537 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 AURKCQ9UQB9 309 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 K7ESM1 405 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC7O00311 574 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NME4O00746 187 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CLGNO14967 610 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPC2O15144 300 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTA4O15217 222 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP4BO15327 924 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH1O95259 989 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PGLSO95336 258 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP10O95393 424 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-CO1P00395 513 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PRLP01236 227 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 THBS1P07996 1170 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM18P0DKX4 95 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK1P28482 360 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 AKT1P31749 480 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GSK3BP49841 420 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPPLY3P57055 190 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPEQ05469 1076 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNB3Q05901 458 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF2Q12933 501 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PWP1Q13610 501 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2H2Q13888 395 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 IMPG1Q17R60 797 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PERM1Q5SV97 790 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR5Q6UX68 686 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SYVN1Q86TM6 617 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMARCE1-201ENST00000264640 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CD200R1Q8TD46 325 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf30Q96M34 536 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 BIRC8Q96P09 236 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 EGFL8Q99944 293 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG2Q9H553 416 aa6.8□□□□□ -1.32
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