RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 DNASE1L2Q92874 299 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TBCCD1Q9NVR7 557 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 MGAT4DA6NG13 374 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 GABARAPO95166 117 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 VIPR1P32241 457 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 KEAP1Q14145 624 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 RGNQ15493 299 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TEAD2Q15562 447 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 OR4A15Q8NGL6 344 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 APH1BQ8WW43 257 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 SLC16A5O15375 505 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 JRKO75564 520 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 IDSP22304 550 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TTC23LQ6PF05 361 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM220Q6QAJ8 160 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 P2RY8Q86VZ1 359 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ELMOD1Q8N336 334 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CHPT1Q8WUD6 406 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 APOL4Q9BPW4 351 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ACOT13Q9NPJ3 140 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 USP34Q70CQ2 3546 aa24.61■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM247A6NEH6 219 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 RGS10O43665 173 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CBFA2T3O75081 653 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 FGF18O76093 207 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TGFB1P01137 390 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ITGB8P26012 769 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NUDT6P53370 316 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 FAM124AQ86V42 546 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ENTHD1Q8IYW4 607 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PROX1Q92786 737 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF347Q96SE7 839 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NRTNQ99748 197 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 RNF208Q9H0X6 261 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ASAH2Q9NR71 780 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 C1orf226A1L170 272 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CLDN25C9JDP6 229 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 SUV39H1O43463 412 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 MYO1DO94832 1006 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 JUNDP17535 347 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 DGKEP52429 567 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 YIPF6Q96EC8 236 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 YME1L1Q96TA2 773 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PCM1Q15154 2024 aa24.6■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NPC1O15118 1278 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CXCL14O95715 111 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ACVR2AP27037 513 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ITGA1P56199 1179 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 HBA1P69905 142 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 HEPHQ9BQS7 1158 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 OR51B5Q9H339 312 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 GULP1Q9UBP9 304 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NPIPB8E9PQR5 432 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 POU2F1P14859 743 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 LAG3P18627 525 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 STARD3Q14849 445 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ACOX1Q15067 660 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 GRHL2Q6ISB3 625 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 MMP21Q8N119 569 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 IRF7Q92985 503 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 FEVQ99581 238 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 CHST8Q9H2A9 424 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 DAPK2Q9UIK4 370 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.59■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 J3KTA2 159 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 BCAP31P51572 246 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 NTHL1P78549 312 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 RELAQ04206 551 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 C9P02748 559 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 WDR48Q8TAF3 677 aa24.58■■□□□ 1.53
RAB40C-201ENST00000248139 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms