RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO2A1Q92959 643 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 APOL2Q9BQE5 337 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 BDH2Q9BUT1 245 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0U1RQJ8 604 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPR1 153 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR2W5A6NFC9 320 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 H7C0C1 242 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 QSOX1O00391 747 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 NDC80O14777 642 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA9O76027 345 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CRTAMO95727 393 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TACR1P25103 407 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5OP48047 213 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 AGTR2P50052 363 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R50P59544 299 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 COPS2P61201 443 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 VRK3Q8IV63 474 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC170Q8IYT3 715 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.37■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPV9 198 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM64A6NGJ6 449 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM64BA6NI03 449 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 H7C0S8 307 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PEX1O43933 1283 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RPN2P04844 631 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 HLCSP50747 726 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PACS1Q6VY07 963 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 P3H2Q8IVL5 708 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ELP5Q8TE02 316 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF592Q92610 1267 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ALG3Q92685 438 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA13Q96N96 652 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RBP3P10745 1247 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 EPXP11678 715 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CTNNA2P26232 953 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A5P58743 744 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CBLBQ13191 982 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FAM53BQ14153 422 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SFT2D3Q587I9 215 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 AADACL2Q6P093 401 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FREM3P0C091 2139 aa15.35■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 KRT87PA6NCN2 255 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 OR14I1A6ND48 311 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 BCKDKO14874 412 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 P2RX6O15547 441 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PHF2O75151 1096 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 VPS26AO75436 327 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GOSR1O95249 250 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms