RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CPNE1Q99829 537 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MACROD1Q9BQ69 325 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 LHPPQ9H008 270 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 H0YIG0 161 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PCDH17O14917 1159 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 DDAH2O95865 285 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SERPIND1P05546 499 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 UQCRHP07919 91 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 GSTA2P09210 222 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 IL1RNP18510 177 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SYT16Q17RD7 645 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CEP97Q8IW35 865 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NDUFS4O43181 175 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 HNMTP50135 292 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 C8orf74Q6P047 294 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 IQCKQ8N0W5 287 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PRR7Q8TB68 274 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NEIL2Q969S2 332 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 OR4K3Q96R72 315 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 OARD1Q9Y530 152 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.61■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TRBC2A0A5B9 178 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SGK494L7N484 410 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 STMN1P16949 149 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 STX2P32856 288 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 GP5P40197 560 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SKP1P63208 163 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CDKL1Q00532 357 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 RGS1Q08116 209 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ATG9BQ674R7 924 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZNF787Q6DD87 383 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CYS1Q717R9 158 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 KCT2Q8NC54 265 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 C19orf60Q96EN9 201 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 RBBP8Q99708 897 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.6■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 FAM159BA6NKW6 160 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CLDN1O95832 211 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 CCDC166P0CW27 439 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 COL8A1P27658 744 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 MAGEA4P43358 317 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 XCR1P46094 333 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PWP1Q13610 501 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 HERC3Q15034 1050 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.59■□□□□ 0.89
NME4-201ENST00000219479 ZNF592Q92610 1267 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms