RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 PDHA2P29803 388 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 RPA4Q13156 261 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 KCNAB2Q13303 367 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 PMS2P3Q13401 168 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 RAB39AQ14964 217 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 LAS2Q8IYD9 372 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ZNF366Q8N895 744 aa11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 NEIL2Q969S2 332 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 MTERF3Q96E29 417 aa11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 KRT87PA6NCN2 255 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 GABRR3A8MPY1 467 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 DPM1O60762 260 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 FKBP9O95302 570 aa11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 STARD3Q14849 445 aa11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 C10orf111Q8N326 155 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 RNF175Q8N4F7 328 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ARRDC3Q96B67 414 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.69□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 LILRB5O75023 590 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 SOD1P00441 154 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 KEAP1Q14145 624 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 PDGFRLQ15198 375 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ZNF691Q5VV52 312 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 KRT78Q8N1N4 520 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 SUSD6Q92537 303 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 REEP1Q9H902 201 aa11.68□□□□□ -0.54
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CLN8-212ENST00000637083 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.68□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 PRRT4C9JH25 899 aa11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 HSD17B2P37059 387 aa11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 RBBP4Q09028 425 aa11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 SLC14A1Q13336 389 aa11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CLN8-212ENST00000637083 NEDD8Q15843 81 aa11.67□□□□□ -0.54
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