RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 UNC50Q53HI1 259 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MND1Q9BWT6 205 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ING3Q9NXR8 418 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DPPA5A6NC42 116 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MAN2B1O00754 1011 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TEX28O15482 410 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TGM5O43548 720 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SSNA1O43805 119 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RCBTB2O95199 551 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HMGCLP35914 325 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ST3GAL3Q11203 375 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ELOCQ15369 112 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LGI4Q8N135 537 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BIRC7Q96CA5 298 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 OR2M4Q96R27 311 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 IFT27Q9BW83 186 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RMI1Q9H9A7 625 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TRBC2A0A5B9 178 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 H0YJX3 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RBBP4Q09028 425 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6AP1Q15904 470 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NRROSQ86YC3 692 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GPR65Q8IYL9 337 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ELOA3Q8NG57 546 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NDC1Q9BTX1 674 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 AIG1Q9NVV5 245 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 IFT52Q9Y366 437 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SDHDO14521 159 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LILRB3O75022 631 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 BCHEP06276 602 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TACSTD2P09758 323 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CSF2RAP15509 400 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 SYN1P17600 705 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 C5AR1P21730 350 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RORCP51449 518 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 CDKN2DP55273 166 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RPA4Q13156 261 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 FADDQ13158 208 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 IL18Q14116 193 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DHCR24Q15392 516 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 USP30Q70CQ3 517 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 NPWQ8N729 165 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 GINS4Q9BRT9 223 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 UCK2Q9BZX2 261 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ETAA1Q9NY74 926 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 H0YAE9 185 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 TP73O15350 636 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DFNA5O60443 496 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 PRKD3O94806 890 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-228ENST00000636120 DHFRP00374 187 aa6.26□□□□□ -1.41
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