RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SYT5	O00445	386 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KDM1A	O60341	852 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TPH1	P17752	444 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FOXN2	P32314	431 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	XCR1	P46094	333 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HLCS	P50747	726 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	GEM	P55040	296 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SLC26A5	P58743	744 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	POU4F3	Q15319	338 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	EXT1	Q16394	746 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	LGI4	Q8N135	537 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CST8	O60676	142 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FKBP9	O95302	570 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	C1orf105	O95561	183 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CDKN2B	P42772	138 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RHAG	Q02094	409 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CBLB	Q13191	982 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ITIH4	Q14624	930 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KAZN	Q674X7	775 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	DSCAM	O60469	2012 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SGK494	L7N484	410 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJB6	O75190	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CELA3A	P09093	270 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TNNT1	P13805	278 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	IL1RN	P18510	177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RBL1	P28749	1068 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NR2C2	P49116	596 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	WNT3	P56703	355 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	MYL5	Q02045	173 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	VAT1	Q99536	393 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CR1	P17927	2039 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HAT1	O14929	419 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ANXA9	O76027	345 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HRG	P04196	525 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NID1	P14543	1247 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	AOAH	P28039	575 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	AGTR2	P50052	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TAS2R50	P59544	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FAM53B	Q14153	422 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NSDHL	Q15738	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	LPAR4	Q99677	370 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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